El funcionamiento de la Facultad de Odontología de la UNAP se viene desarrollando en la Ciudad Universitaria 2da Etapa, tenemos una superficie total de 15,000m², el área destinada a la facultad es de 2,000m², la edificación consta de varios módulos distribuidos en diferentes ambientes como oficinas, laboratorios, aulas, servicios.
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En el primer piso se ubican:
- El pabellón administrativo, donde funcionan las siguientes oficinas:
- Decanato/Coordinación.
- Secretaria Académica.
- Dirección de Escuela de Formación Profesional.
- Departamento Académico.
- Oficina de Investigación.
- Coordinación de Internado.
- Oficina de Postgrado.
- Oficina de Asuntos Económicos y Presupuestales.
- Oficina de Asuntos Académicos.
- Biblioteca especializada, sala de lectura y de cómputo.
- Sala de reuniones.
- La Clínica Estomatológica:
- Servicio de Diagnostico por Imágenes.
- Servicio de Cirugía Bucomaxilofacial.
- Clínica del Adulto y Adulto Mayor.
- Clínica del Niño y Adolescente.
- Servicio de Proyección Comunitaria.
- Oficinas administrativas de la Clínica: Dirección, Administración, Proveeduría, Admisión, Recepción-Triaje, Almacén, Central de esterilización.
* En el segundo piso tenemos cinco aulas para el dictado de clases y un auditorio multiusos.
* En el tercer piso tenemos:
- Anfiteatro de Anatomía Humana.
- Laboratorio de Embriología-Histología-Patología.
- Laboratorio de Prótesis Dental.
- Laboratorio de Endodoncia-Operatoria Dental.
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